NestedAlign - Accueil

Séquences et structures [?]

Veuillez entrer la séquence et la structure du premier ARN ci-dessous (formats supportés : parenthésés, BPSeq et CT) :

...ou à partir d'un fichier :

Veuillez entrer la séquence et la structure du second ARN ci-dessous (formats supportés : parenthésés, BPSeq et CT) :

...ou à partir d'un fichier :

Paramètres

1) Score pour la suppression ou l'insertion d'une base non appariée
2) Score pour la conservation d'une base non appariée
3) Score pour la substitution d'une base non appariée en une autre
4) Score pour la suppression ou l'insertion d'une paire de base
5) Score pour la conservation d'une paire de base
6) Score pour la substitution d'une base dans une paire de base
7) Score pour la substitution totale d'une paire de base
8) Score pour la scission d'une paire en deux bases non appariées ou la fusion de deux bases non appariées en une paire de base, sans substitution
9) Score pour la scission ou la fusion avec substitution d'une base
10) Score pour la scission ou la fusion avec deux substitutions de bases
11) Score pour l'altération (à gauche ou à droite) d'une paire en une base non appariée ou pour la complétion (à gauche ou à droite) d'une base non appariée en une paire de base, sans substitution
12) Score pour l'altération ou la complétion avec substitution

...ou à partir d'un fichier :

Sélectionner le fichier contenant la matrice "full" :

Autres options

Afficher le temps d'exécution de la comparaison
Afficher en plus la représentation graphique des résultats en utilisant VARNA

M'envoyer un email contenant les résultats de la comparaison

Entrez ici votre adresse email :